El objetivo primordial de la Contraloría Interna Municipal, es la vigilancia, control y fiscalización del uso correcto de los recursos humanos, materiales  y financieros que disponen las direcciones, coordinaciones y departamentos para la ejecución de sus programas de trabajo y el cumplimiento de sus objetivos y metas; además es el área que revisa y evalúa el grado de eficacia y eficiencia con que áreas administrativas alcanzan dichas metas y objetivos, haciendo las recomendaciones que sean necesarias para mejorar su funcionamiento.